高通量测序可以协助溯源病毒、监控病毒变异趋势、掌握病毒的发展方向

2月2日晚8时，南京闹市区的江苏路，行人寥落，车辆稀疏。但坐落在此的江苏省疾病预防控制中心(以下简称江苏省疾控中心)灯火通明，4楼的病原微生物实验室里脚步匆匆、热闹不已。

“今晚的检测报告大约多久能出来?”

“大概9点半到10点.”

“一会还有一批样本马上到。”

实验室内外，大家传递着有关检验的最新消息。

疫情发生以来，江苏省13个设区市疑似新冠病毒肺炎的初筛阳性标本，都会送到这里复核确证。实验室内，检验人员受理着病毒样品，提取核酸、加样，上机检测，基因测序。

江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所副主任技师田华，在密闭的负压生物安全二级实验室，身着隔离衣、防护服，戴着N99口罩、护目镜，套着鞋套，靴套和两层医用乳胶手套，从接收的各设区市新冠病毒咽拭子标本里提取病毒RNA。

核酸提取，直接接触病毒，是整个实验流程中最危险的一环。隔着实验室玻璃窗看起来，全副武装的田华像一个臃肿的“小黄人”。

“在里面连续做了3个多小时的实验，头晕得要命。”实验结束后，田华终于卸下一身疲惫。她告诉科技日报记者，因为新冠病毒传染性高，所以每一步操作都小心翼翼、精神高度紧张，刚才才做了一个多小时，就有点晕厥的感觉。“我告诉自己，扛住扛住，把这批做完就出来了，拼了。否则出去再进来，一来耗费医疗物资，二来增加感染风险，三来同事还等着出具核酸检测报告。”

如今，检验人员每天3班24小时轮班，他们在负压实验室一“憋”就是三四个小时。在进实验室前都不敢喝水，吃东西。从拿到样本到出具检测报告，时间约为6小时左右。

1月10日，中国公布新冠病毒全基因组序列。但随着疫情不断发展，病毒是否会变异得让人类捉摸不透，如何监控基因变异?

高通量基因测序技术，是江苏省疾控中心应对新冠病毒的杀手锏，“高通量测序可以协助溯源病毒、监控病毒变异趋势、掌握病毒的发展方向，也可以为药物研发提供参考。”该中心病原微生物研究所所长崔仑标说，借助该技术，2013年他们曾检出H7N9和H3N2两种亚型的流感病毒可以同时感染人。2016年检出一种新型环状病毒。

该中心病原微生物研究所技师赵康辰，正向装有病毒核酸的试剂管中添加反应酶。“同事做好核酸提取后，我会用反应酶将核酸片段化，再加入磁珠，吸附病毒的核酸，去除人基因组、试剂残留物等杂质。经过吸附、清洗，再将磁珠上的病毒核酸洗脱下来，加上分子标签，连接到测序仪上，检测病毒核酸序列。”赵康辰说，一套完整的病毒基因测序流程，36-48小时即可完成。

目前，江苏省疾控中心已经做了十多例新冠病毒的高通量测序。“我们也会挑选一些重症病例和轻症病例做基因组的比较，看看两类人群携带的病毒基因是否有差异，目前，江苏所有的新冠病毒基因序列，与国家公布的病毒全基因组序列高度一致。”崔仑标说。

行走在病原微生物实验室，擦肩而过的多是80后、90后。1月20日以来，他们已经连续工作近半月，有的退了回家过年的车票留在南京，有的甚至住在办公室。

从除夕到初三，赵康辰一直在实验室没回家，瞌睡了就趴下打个盹。该中心病原微生物研究所副主任医师吴涛、陈银、朱小娟等人春节期间留守南京，与家人分隔两地。

崔仑标是扬州人，今年过年，他和身为医生的妻子都默契地选择留在南京。“国家养兵千日用兵一时，现在到我们亮剑出手的时候了。”

这个两个孩子的爸爸，已经十多天没有跟儿子们说话了。每天深夜到家，儿子们已经睡去，上班时，儿子们还在熟睡。

但“战斗”着的崔仑标并不孤单。前几天晚10点，他突然接到一个外卖小哥的电话，下楼一看，不知是哪位热心人士送来的鸭血粉丝汤和热乎乎的卷饼。“你们真不容易。”小哥的一句话，让崔仑标暖心到现在。

“崔博(士)快来，我们一起拍一张合影，20：20啦。”当时钟指向20：20，崔仑标被实验室外的年轻同事们招呼着，2020年2月2日20时20分就这样定格在他们的人生中。(金凤)